Program dari JARING-Nusantara lainnya adalah mendukung perlawanan terhadap Illegal, Unreported, Unregulated (IUU) Fishing, program tersebut dilakukan dengan cara :
- Menginventarisasi setiap tindakan IUU Fishing di masing-masing lokasi dampingan anggota JARING-Nusantara
- Mendorongkan Pemerintah selaku pengambil kebijakan untuk melakukan penegakan hukum atas praktek IUU Fishing
- Melakukan kampanye dan mendorongkan pelaksanaan praktek perikanan yang non-IUU fishing